El clima en Chuy es templado y húmedo, con veranos calurosos (máximas promedio de 28ºC) e inviernos fríos (mínimas promedio de 5ºC y heladas frecuentes). El otoño y la primavera tienen temperaturas de transición, en el entorno de los 20ºC.
Como activa zona comercial y de paso entre Brasil y Uruguay, la ciudad de Chuy es muy visitada durante todo el año. El verano es la época de mayor afluencia, con ocupación completa en hoteles, ya que es la temporada alta del departamento. Además de los turistas alojados en Chuy, muchos veraneantes que llegan a las playas de Rocha aprovechan para ir de compras por la ciudad, recorren sus puestos y freeshops por la mañana y almuerzan en algún espeto corrido al mediodía. De tarde el calor puede ser agobiante, así que es casi obligatorio visitar la Barra del Chuy, el paradisíaco balneario situado a solo 8 kilómetros de la ciudad.
Sin dudas, el Carnaval en febrero es una fecha especial para viajar al Chuy. Ambas fronteras se unen para celebrar un carnaval único, donde los tambores uruguayos se mezclan con las Escolas do Samba típicas de Brasil. Conviene reservar con anticipación el alojamiento, ya que los días de Carnaval son muy demandados por el turismo.
El otoño y la primavera son épocas perfectas para visitar el Chuy. El clima es agradable tanto para recorrer los comercios como para hacer paseos al aire libre en los alrededores de la ciudad. En invierno la ciudad se ve algo más tranquila, pero todas sus propuestas de compras, gastronomía y hospedaje se mantienen en funcionamiento.